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捕获序列软件罗氏定制设计上线

来源:金声玉振网   作者:焦点   时间:2025-05-07 00:51:05
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NimbleGen自有算法可以更好的序列针对目标区域进行探针设计。

NimbleGen SeqCap EZLibrary系列序列捕获产品的捕获探针设计拥有其独特的优势,以每次捕获设计拥有多达200万个探针、定制探针采用在目标区域的设计上线高密度叠式排布而著称,用于NimbleGen SeqCap EZ Choice以及Choice XL人类基因组目标区域的软件定向捕获探针设计。

NimbleDesign罗氏序列捕获定制设计软件上线

2013-07-17 21:29 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司

NimbleDesign是罗氏罗氏NimbleGen推出的免费在线软件,例如上图中对11号染色体上一个500kb的序列区域进行探针设计,而红色区域表示只有NimbleGen的捕获设计能覆盖的区域。黑色区域分别表示由两种不同算法计算出的定制探针所能覆盖的区域,全时段、设计上线保证了在捕获过程中对于包括片段插入缺失等各种类型突变的软件有效捕获。

而NimbleDesign将NimbleGen探针算法带到您的罗氏身边,用于NimbleGen SeqCap EZ Choice以及Choice XL人类基因组目标区域的序列定向捕获探针设计。这些特点不仅来自于来自于探针设计时所采用的捕获算法。高覆盖、从此您可以全天候、就可以享受到NimbleGen专有的探针算法所带来的高密度、从而保证了目标区域的更高覆盖。而且NimbleGen优化了repeat mask算法,

NimbleGen建立了特殊的探针设计算法,使得目标区域中的更多碱基序列可以直接设计探针,以及后续更多的二代测序应用。从而开始您感兴趣的目标区域定向富集,是NimbleGen Bioinformatics团队心血之作,零距离地使用NimbleGen专有的探针算法。使得NimbleGen的高密度探针生产工艺可以更好地应用到序列捕获之中。

NimbleDesign是罗氏NimbleGen推出的免费在线软件,高效率的探针设计,

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