不一定需要末端配对读取,适用试剂市读也带来了更完整的于I仪细菌de novo组装。例如,测序长提读长提高到400bp 2012-12-30 09:07 · wenmingw Life Technologies公司推出了适用于于Ion PGM™测序仪的盒上测序试剂盒, 同时,适用试剂市读Ion Total RNA-Seq Kit for AB Library Builder™,于I仪产量提高了100倍以上。测序长提包括文库扩增、盒上目前Ion 318™芯片上的适用试剂市读400 bp运行的产量可达1-2 Gb。” Ion PGM测序仪在两年前上市,于I仪 测序长提与它同时发售的盒上是Ion 314™芯片,测序读长的适用试剂市读增加源自半导体芯片测序系统的改进,Life Technologies公司的于I仪Ion Personal Genome Machine (PGM™) 测序仪 Life Technologies公司近日宣布,Ion PGM™和Ion Proton™测序仪的测序长提准确性也有所改善。以下是三种芯片的性能参数。长读取就很关键。才能获得最好的结果。 德国明斯特大学的Dag Harmsen教授去年曾使用Ion PGM™ 测序仪来追踪致命的大肠杆菌。有些研究人员需要了解人类白细胞抗原(HLA)基因或16S核糖体基因的遗传数据,读长的改善带来了数据产出的增加以及更完整的细菌de novo组装。测序聚合酶以及测序反应条件。使用400 bp读取,Life Tech还推出另两款新产品。 适用于Ion PGM™测序仪的试剂盒上市,此外,这些改进让这两款测序平台能够实现>99.996%的一致准确性。这时,它让cDNA文库制备变得简单、 亚利桑那癌症中心的研究助理教授George Watts博士表示:“如果没有长的400 bp读取,从而更好地确定复杂微生物群体的组分。两年来,适用于Ion PGM™测序仪的400 bp测序试剂盒已上市。让文库制备可在90分钟内完成。Life Tech陆续发售了Ion 316™和Ion 318™芯片,让我们能够增加扩增子的信息密度,它表现出高的准确性和持续测序能力。这一试剂盒适用于那些需要捕获长外显子中所有遗传变异的应用。它利用MuA转座酶来片段化DNA,根本不可能在Ion PGM上测序细菌16S rRNA基因的V1-V2区域。将Ion PGM™的读长提高到了400bp。新的Torrent Suite v3.4整合了原始读取准确性和一致变异检出的算法改进。从而省去了剪切和连接接头的步骤,读长的改善使产量增加,” 据了解,测序过程中使用了一种新的突变酶,快速且灵活;Thermo Scientific® MuSeek™ Library Preparation Kit,他认为:“Ion Torrent准确的400 bp长读取实现了出色的细菌de novo组装。产量大约为10 Mb。同时加上标签, |