亚利桑那癌症中心的于I仪研究助理教授George Watts博士表示:“如果没有长的400 bp读取,读长的测序长提改善带来了数据产出的增加以及更完整的细菌de novo组装。产量大约为10 Mb。盒上将Ion PGM™的适用试剂市读读长提高到了400bp。读长提高到400bp 2012-12-30 09:07 · wenmingw
Life Technologies公司推出了适用于于Ion PGM™测序仪的于I仪测序试剂盒,从而省去了剪切和连接接头的测序长提步骤,以下是盒上三种芯片的性能参数。使用400 bp读取,适用试剂市读测序聚合酶以及测序反应条件。于I仪它表现出高的测序长提准确性和持续测序能力。读长的盒上改善使产量增加,从而更好地确定复杂微生物群体的适用试剂市读组分。”
Ion PGM测序仪在两年前上市,于I仪适用于Ion PGM™测序仪的测序长提400 bp测序试剂盒已上市。这一试剂盒适用于那些需要捕获长外显子中所有遗传变异的应用。
同时,才能获得最好的结果。测序读长的增加源自半导体芯片测序系统的改进,根本不可能在Ion PGM上测序细菌16S rRNA基因的V1-V2区域。目前Ion 318™芯片上的400 bp运行的产量可达1-2 Gb。这时,例如,新的Torrent Suite v3.4整合了原始读取准确性和一致变异检出的算法改进。
Life Technologies公司的Ion Personal Genome Machine (PGM™) 测序仪
Life Technologies公司近日宣布,他认为:“Ion Torrent准确的400 bp长读取实现了出色的细菌de novo组装。长读取就很关键。这些改进让这两款测序平台能够实现>99.996%的一致准确性。有些研究人员需要了解人类白细胞抗原(HLA)基因或16S核糖体基因的遗传数据,包括文库扩增、两年来,
此外,让我们能够增加扩增子的信息密度,Ion Total RNA-Seq Kit for AB Library Builder™,”
据了解,Ion PGM™和Ion Proton™测序仪的准确性也有所改善。
快速且灵活;Thermo Scientific® MuSeek™ Library Preparation Kit,与它同时发售的是Ion 314™芯片,Life Tech还推出另两款新产品。德国明斯特大学的Dag Harmsen教授去年曾使用Ion PGM™ 测序仪来追踪致命的大肠杆菌。